Laboratoire d'Etudes Transcriptomiques et de Génomique Appliquée - Plateforme Biopuces - IPL

Activités de recherche de la plateforme

• Activités de Recherche de la plate-forme :

  
  

  1. Equipes de recherche associées (académiques et industrielles) :
     
     

     • Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène-environnement sur la santé des populations, Philippe AMOUYEL - Unité 508 Institut Pasteur de Lille - INSERM - Université de Lille 2
     • Mécanismes moléculaires de la pathogénie bactérienne, Camille LOCHT - Unité 629 Institut Pasteur de Lille - INSERM - Université de Lille 2
     • Synthèse, structure et fonction des biomolécules, Oleg Melnyk - UMR 8525 Institut Pasteur de Lille - CNRS - Université de Lille 2
     • Mécanismes cellulaires et moléculaires de la réaction inflammatoire en pathologie immuno-allergique respiratoire. André-Bernard Tonnel - Unité 416 Institut Pasteur de Lille - INSERM - Université de Lille 2
     • Régulation transcriptionnelle au cours de la tumorigenèse mammaire. Yvan De Launoit - UMR8117 - Institut Pasteur de Lille - CNRS - Université de Lille 1
     • Unité des Bordetella, Nicole GUISO, Institut Pasteur, Paris
     • Société Gènes Diffusion
     • Société Génoscreen

   

  2. Thèmes de recherche abordés :
     
     

     • Explorations mécanismes de virulence Bordetella pertussis
     • Recherche Gènes Susceptibilité maladie d'Alzheimer
     • Nouvelle chimie de fixation d'acides nucléiques aux lames de verre
     • Développement d'un algorithme de détection de structures opéroniques - intégration structures/régulation transcriptomique
     • Amélioration et optimisation de l'étape de synthèse des cibles fluorescentes au départ des ARNm ou de l'ADN génomique pour les applications des puces à ADN (Utilisation du logiciel "FindExpress" dans l'identification d'amorces spécifiques)
     • Compréhension des mécanismes d'interaction moléculaire au niveau d'une surface solide
     • Détection et identification de pathogènes par la technologie des puces à ADN

 

• Programme nationaux et européens :

  
  

  • Fonds FEDER "Interreg II" :
    Convention attributive de subvention n°99.6.129. Collaboration Université Libre de Bruxelles (Institut de biologie et de médecine moléculaires, IBMM) - Institut Pasteur de Lille. De juin 1999 à juin 2001.

  • Convention GenHomme n°024 90 6023 "Coquepuce" :
    Partenaires : Aventis Pasteur (Dr Luc AUJAME, coordonnateur), INSERM U629 (Dr Camille LOCHT), Institut Pasteur, Unité des Bordetelles (Dr Nicole GUISO). Du 02-10-01 au 02-10-04.

  • ARCir Partenariats Région Nord Pas de Calais :
    Partenaire : Unité INSERM U 416 (Dr. Philippe Gosset, Coordonnateur). Projet Theradam 2005-2008.

  • ARCir Partenariats Région Nord Pas de Calais :
    Partenaires : UMR 8525 (Dr. Oleg Melnyk, Coordonnateur). Projet Puces " Nano-3D " 2004-2006, IEMN (Institut d'Electronique de Microélectronique et de Nanotechnologie), CIB (Centre Intégré de Bioinformatique).

 

• Innovation technologique

  
  

  Développement d'une nouvelle chimie de fixation d'acides nucléiques aux lames de verre (cf brevets) et de nouvelles méthodes de détection/génotypage sur biopuces.

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